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Illumina FC-121-3001--TruSeq DNA PCR-Free LT Library

更新時(shí)間:2025-06-03      點(diǎn)擊次數(shù):50
Illumina FC-121-3001--TruSeq DNA PCR-Free LT Library 產(chǎn)品介紹
在基因測(cè)序領(lǐng)域,構(gòu)建高質(zhì)量的 DNA 文庫(kù)是獲取精準(zhǔn)數(shù)據(jù)的關(guān)鍵前提。Illumina 公司推出的 FC-121-3001--TruSeq DNA PCR-Free LT Library,憑借創(chuàng)新的技術(shù)和的性能,為科研人員開(kāi)展全基因組測(cè)序(WGS)等研究工作提供了理想的解決方案。
一、產(chǎn)品概述
TruSeq DNA PCR-Free LT Library 屬于低通量(LT)文庫(kù)制備試劑盒,主要用于構(gòu)建適用于 Illumina 測(cè)序平臺(tái)的 DNA 文庫(kù) 。其設(shè)計(jì)巧妙,可實(shí)現(xiàn) 24 個(gè)樣本的手動(dòng)處理,這一特性使得它尤其適合小型實(shí)驗(yàn)室的研究項(xiàng)目,或是針對(duì)樣本量有限但需精細(xì)分析的科研場(chǎng)景。該試劑盒致力于簡(jiǎn)化實(shí)驗(yàn)流程,同時(shí)保障測(cè)序數(shù)據(jù)的高質(zhì)量,幫助科研人員高效獲取復(fù)雜基因組的全面信息。
二、核心技術(shù)亮點(diǎn)
  1. 免 PCR 文庫(kù)構(gòu)建技術(shù):傳統(tǒng)的文庫(kù)構(gòu)建方法常依賴(lài) PCR 擴(kuò)增步驟,然而這可能引入擴(kuò)增偏好性,導(dǎo)致某些 DNA 片段過(guò)度或不足擴(kuò)增,影響測(cè)序結(jié)果的準(zhǔn)確性和全面性 。TruSeq DNA PCR-Free LT Library 開(kāi)創(chuàng)性地去除了 PCR 過(guò)程,有效規(guī)避了 PCR 帶來(lái)的偏差,確保文庫(kù)中各類(lèi) DNA 片段的比例更接近樣本原始狀態(tài)。這意味著科研人員能夠獲得更均一、更能真實(shí)反映樣本基因組全貌的文庫(kù),為后續(xù)精準(zhǔn)檢測(cè)各類(lèi)遺傳變異(如單核苷酸多態(tài)性 SNP、插入缺失 InDel 等)奠定了堅(jiān)實(shí)基礎(chǔ)。

  1. 靈活的讀長(zhǎng)適配能力:不同的研究項(xiàng)目對(duì)測(cè)序讀長(zhǎng)的需求各異。該試劑盒具備出色的靈活性,能夠適配多種讀長(zhǎng)設(shè)置,可滿足從較短讀長(zhǎng)用于快速篩查,到較長(zhǎng)讀長(zhǎng)用于解析復(fù)雜基因組區(qū)域的多樣化需求 。例如,在對(duì)微生物基因組進(jìn)行測(cè)序時(shí),較短讀長(zhǎng)即可滿足快速鑒定物種的需求;而在研究動(dòng)植物復(fù)雜基因組的結(jié)構(gòu)變異時(shí),較長(zhǎng)讀長(zhǎng)能更好地跨越重復(fù)序列等復(fù)雜區(qū)域,準(zhǔn)確識(shí)別變異類(lèi)型,為深入探究遺傳機(jī)制提供有力支持。

  1. 高效的片段化與修復(fù)技術(shù):試劑盒在 DNA 片段化過(guò)程中,采用了優(yōu)化的物理或酶切方法,能夠?qū)⒒蚪M DNA 精準(zhǔn)地切割成適宜長(zhǎng)度的片段 。這些片段隨后經(jīng)過(guò)末端修復(fù)、加 A 尾以及連接測(cè)序接頭等一系列精細(xì)操作,確保每個(gè) DNA 片段都能被有效捕獲和測(cè)序。這一高效的片段化與修復(fù)技術(shù),不僅提高了文庫(kù)構(gòu)建的成功率,還保證了文庫(kù)中 DNA 片段的質(zhì)量和完整性,為后續(xù)測(cè)序反應(yīng)的順利進(jìn)行提供了保障。

三、產(chǎn)品性能優(yōu)勢(shì)
  1. 出色的覆蓋度:在對(duì)基因組中傳統(tǒng)上難以測(cè)序的區(qū)域,如高 GC 含量區(qū)域、啟動(dòng)子區(qū)域以及重復(fù)序列區(qū)域的覆蓋上,TruSeq DNA PCR-Free LT Library 表現(xiàn) 。高 GC 含量區(qū)域由于其堿基組成特點(diǎn),在測(cè)序過(guò)程中易出現(xiàn)信號(hào)弱、難以準(zhǔn)確識(shí)別堿基的問(wèn)題;啟動(dòng)子區(qū)域的結(jié)構(gòu)和功能特殊性也增加了測(cè)序難度;而重復(fù)序列則可能導(dǎo)致測(cè)序錯(cuò)誤或丟失信息。但該試劑盒憑借的技術(shù)設(shè)計(jì),能夠有效克服這些挑戰(zhàn),為科研人員提供更全面、準(zhǔn)確的基因組覆蓋信息,助力挖掘這些關(guān)鍵區(qū)域的遺傳信息,例如在研究基因調(diào)控機(jī)制時(shí),準(zhǔn)確解析啟動(dòng)子區(qū)域的序列變異和甲基化狀態(tài)。

  1. 數(shù)據(jù)質(zhì)量高:得益于免 PCR 技術(shù)和優(yōu)化的文庫(kù)構(gòu)建流程,該試劑盒生成的測(cè)序數(shù)據(jù)質(zhì)量 。數(shù)據(jù)質(zhì)量分?jǐn)?shù)(如 Q30 分?jǐn)?shù))表現(xiàn)優(yōu)異,意味著在測(cè)序數(shù)據(jù)中,堿基識(shí)別準(zhǔn)確率達(dá)到 99.9% 以上的比例較高。高質(zhì)量的數(shù)據(jù)減少了后續(xù)數(shù)據(jù)分析中的錯(cuò)誤校正工作量,提高了研究結(jié)果的可靠性。在疾病基因檢測(cè)、腫瘤基因組分析等對(duì)數(shù)據(jù)準(zhǔn)確性要求極為苛刻的領(lǐng)域,該試劑盒的數(shù)據(jù)質(zhì)量?jī)?yōu)勢(shì)能夠確保準(zhǔn)確檢測(cè)到低頻變異,為疾病的精準(zhǔn)診斷和個(gè)性化治療提供關(guān)鍵依據(jù)。

  1. 簡(jiǎn)化實(shí)驗(yàn)流程:試劑盒采用了一體化的設(shè)計(jì)理念,所有試劑和耗材均精心配置,為全基因組測(cè)序應(yīng)用提供了簡(jiǎn)便、全面的文庫(kù)制備方案 。整個(gè)實(shí)驗(yàn)流程摒棄了繁瑣的凝膠電泳步驟,減少了實(shí)驗(yàn)操作步驟和時(shí)間,同時(shí)降低了人為操作誤差的引入風(fēng)險(xiǎn)。例如,在樣本處理過(guò)程中,磁珠法的應(yīng)用使得 DNA 片段的純化和篩選更加高效、便捷,科研人員無(wú)需復(fù)雜的技術(shù)和大量的時(shí)間投入,即可輕松完成文庫(kù)構(gòu)建,大大提高了實(shí)驗(yàn)效率,使研究工作能夠更快速地推進(jìn)。

四、應(yīng)用領(lǐng)域
  1. 基礎(chǔ)基因組學(xué)研究:在探索各類(lèi)生物的基因組結(jié)構(gòu)與功能方面,TruSeq DNA PCR-Free LT Library 發(fā)揮著重要作用 。對(duì)于小型基因組,如細(xì)菌基因組,該試劑盒能夠快速、準(zhǔn)確地完成測(cè)序文庫(kù)構(gòu)建,助力科研人員深入了解細(xì)菌的遺傳特性、進(jìn)化關(guān)系以及與環(huán)境的相互作用機(jī)制。在人類(lèi)基因組研究中,它可用于全基因組重測(cè)序,精準(zhǔn)檢測(cè)個(gè)體間的遺傳變異,為研究人類(lèi)遺傳多樣性、疾病遺傳易感性等提供豐富的數(shù)據(jù)資源,有助于揭示復(fù)雜疾病的發(fā)病機(jī)制,為個(gè)性化醫(yī)療和遺傳咨詢(xún)提供理論基礎(chǔ)。

  1. 腫瘤基因組學(xué)研究:在腫瘤研究領(lǐng)域,準(zhǔn)確解析腫瘤基因組的變異對(duì)于腫瘤的診斷、治療和預(yù)后評(píng)估至關(guān)重要 。該試劑盒能夠高效構(gòu)建腫瘤樣本的 DNA 文庫(kù),通過(guò)對(duì)腫瘤基因組的深度測(cè)序,科研人員可以全面檢測(cè)腫瘤相關(guān)基因的突變、拷貝數(shù)變異等遺傳改變。例如,在尋找腫瘤驅(qū)動(dòng)基因時(shí),高覆蓋度和高質(zhì)量的數(shù)據(jù)能夠幫助識(shí)別出潛在的關(guān)鍵變異,為開(kāi)發(fā)針對(duì)性的靶向治療藥物提供靶點(diǎn);在腫瘤分子分型中,精準(zhǔn)的基因組信息有助于更準(zhǔn)確地對(duì)腫瘤進(jìn)行分類(lèi),指導(dǎo)臨床醫(yī)生制定個(gè)性化的治療方案,提高腫瘤治療效果。

  1. 罕見(jiàn)病研究:許多罕見(jiàn)病由基因變異引起,且發(fā)病率低、病例分散,樣本獲取難度大 。TruSeq DNA PCR-Free LT Library 的低通量特性和高質(zhì)量數(shù)據(jù)產(chǎn)出,使其成為罕見(jiàn)病研究的有力工具。科研人員可以利用該試劑盒對(duì)少量的罕見(jiàn)病患者樣本進(jìn)行深度測(cè)序,精準(zhǔn)檢測(cè)出致病基因的變異,為罕見(jiàn)病的基因診斷、遺傳咨詢(xún)以及開(kāi)發(fā)潛在的治療方法提供關(guān)鍵線索,有助于改善罕見(jiàn)病患者的診療現(xiàn)狀。

五、產(chǎn)品使用說(shuō)明
  1. 樣本要求:該試劑盒適用于多種類(lèi)型的 DNA 樣本,如基因組 DNA、FFPE 樣本來(lái)源的 DNA 等 。但需注意,樣本應(yīng)具備較高的質(zhì)量和完整性,建議使用高質(zhì)量的純化 DNA,起始量一般在 0.1 - 1 μg 之間,具體用量可根據(jù)樣本類(lèi)型和實(shí)驗(yàn)要求進(jìn)行適當(dāng)調(diào)整。在樣本處理前,需對(duì)樣本進(jìn)行嚴(yán)格的質(zhì)量檢測(cè),確保其濃度、純度以及完整性符合實(shí)驗(yàn)要求,以保證文庫(kù)構(gòu)建的成功率和質(zhì)量。

  1. 實(shí)驗(yàn)操作流程:使用 TruSeq DNA PCR-Free LT Library 構(gòu)建文庫(kù)的操作流程相對(duì)簡(jiǎn)便 。首先,對(duì) DNA 樣本進(jìn)行片段化處理,可根據(jù)實(shí)驗(yàn)需求選擇合適的片段化方法和條件,以獲得理想長(zhǎng)度的 DNA 片段。隨后進(jìn)行末端修復(fù)、加 A 尾以及連接測(cè)序接頭等步驟,這些操作均在試劑盒提供的專(zhuān)用試劑和優(yōu)化的反應(yīng)條件下進(jìn)行。最后,通過(guò)磁珠法對(duì)文庫(kù)進(jìn)行純化和篩選,去除雜質(zhì)和未連接的接頭,得到高質(zhì)量的文庫(kù)產(chǎn)物。整個(gè)過(guò)程需嚴(yán)格按照試劑盒說(shuō)明書(shū)的操作步驟進(jìn)行,注意反應(yīng)條件的控制和試劑的使用量,以確保實(shí)驗(yàn)結(jié)果的可靠性和可重復(fù)性。

  1. 系統(tǒng)兼容性:該試劑盒與多種 Illumina 測(cè)序儀器高度兼容,包括 NextSeq 1000、NextSeq 2000、HiSeq 2500、NovaSeq 6000 等 ??蒲腥藛T可根據(jù)自身實(shí)驗(yàn)需求和實(shí)驗(yàn)室設(shè)備條件,靈活選擇合適的測(cè)序儀器進(jìn)行文庫(kù)測(cè)序。在測(cè)序前,需根據(jù)所選儀器的特點(diǎn)和要求,對(duì)測(cè)序參數(shù)進(jìn)行合理設(shè)置,以充分發(fā)揮試劑盒和測(cè)序儀器的性能優(yōu)勢(shì),獲得高質(zhì)量的測(cè)序數(shù)據(jù)。



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